南方科技大学生物系陈炜课题组在Molecular Systems Biology发表最新研究成果

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　　近日，系统生物学国际顶尖学术期刊《Molecular Systems Biology》发表了南方科技大学生物系陈炜教授课题组的一篇研究论文，题为“Global *ysis of regulatory divergence in the evolution of mouse alternative polyadenylation” 。

　　基因表达的变化是不同物种间表型进化的主要动力来源。由于基因表达是一个多层面调控过程，所以可以想象任何一个层面在进化上的变化都将会对这个过程有着重要的贡献。得益于近年来快速发展的二代测序技术，人们可以对基因表达水平，可变剪切，RNA降解以及蛋白质的翻译，甚至于蛋白质的稳定性在不同物种中进行全基因组范围的研究。

　　但是可变聚腺苷酸化(alternative polyadenylation，APA)作为一个在哺乳动物中非常常见且尤为重要的基因转录后调控手段，它在进化过程中分歧的程度，特别是进化中顺式作用原件和反式作用因子的相对贡献目前仍然不清楚。为了研究这些问题，陈炜教授课题组利用基于深度测序的方法，对来自两个父母本小鼠(Mus musculus C57BL/6J 和 Mus spretus SPRET/EiJ)以及它们的杂交子一代(F1) 中表达的聚腺苷酸化位点(polyadenylation sites, pAs)进行了鉴别(见下图)。由于子一代中所有的RNA都处于相同的反式因子环境中，所以观察到的等位基因上的APA差异可以直接归结为来自顺式原件差异所至。而与此同时反式作用因子调控的APA则可以通过比较杂交子一代中等位基因和父母本之间的APA差异来推断。

　　文章来源：南方科技大学

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